Házasságot kötött partnerével Cynthia Nixon amerikai színésznő, a Szex és New York című sorozat, illetve mozifilm egyik szereplője, aki pár éve él kapcsolatban egy nővel.

A híresség és élettársa, Christine Marinoni New York államban kötött házasságot pünkösd idején. A színésznő egy Carolina Herrera, a világhírű divattervező által megálmodott ruhát viselt, több részlet azonban nem került nyilvánosságra a ceremóniáról.

A két nő 2004 óta él együtt. Nixonnak két gyereke született Danny Mozes fotóstól. Marinonival közös gyereke, Max 2011 februárjában született, őt Christine Marinoni hozta világra.