Crohn még augusztus 23-án, 66 évesen, New Yorkba vetett véget életének. A férfi azt követően vált ismertté, hogy a barátja, Jerry Green 1982-ben egyike lett az AIDS első, ismertté vált áldozatainak."A bátyám látta, ahogy barátai meghalnak körülötte, ő meg pedig nem halt meg. Hatalmas túlélői lelkiismeret-furdalást élt át és azt mondogatta magának: mindennek oka kell, hogy legyen" - nyilatkozott a lapnak a férfi húga, Amy Crohn Santagata.

Crohn különleges ellenálló képessége sokat segített az orvostudománynak az AIDS megértésében. Kiderült, hogy a CD4-es fehérvérsejtjeiben nem tudott megtelepedni a HIV-vírus.Az öngyilkosságba menekült férfi a másod-unokatestvére Burrill B. Crohn gasztroenterológusnak, aki elsőként írta le a róla elnevezett kórt, a bél rohamokban jelentkező, krónikus gyulladását. Stephen Crohn úgy érezte, hogy a kutatókkal való együttműködése által továbbviszi az orvostudományban a családi örökséget.