A jelenlegi 29 helyett, csupán 12 egyetem működne önálló intézményként a jövőben, áll a minisztériumi dokumentumban. A terv fontos része a Széll Kálmán Terv felsőoktatási koncepciójának, ami szerint 88 milliárd forintot kívánnak kivonni a felső szintű képzésből. Az elképzelés szerint a megyében működő intézmények közül csupán a soproni székhelyű Nyugat- magyarországi Egyetem maradna önálló, a győri campus integrálódhatna egy másik intézménybe, vagy magán egyetemként működhetne tovább.

A Kisalföld információit nem kívánták az egyetem vezetői kommentálva, arra hivatkoztak, hogy megvárják a kormány végleges álláspontját az ügyben. A város országgyűlési képviselői, Borkai Zsolt, Kara Ákos és Szakács Imre egyaránt úgy nyilatkozott, hogy teljes erejükkel lobbizni fognak az önálló győri egyetem mellett.